Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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CASQ1P31415 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASQ1P31415 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASQ1P31415 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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