Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC9P31274 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC9P31274 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms