Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA9P31269 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA9P31269 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms