Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTGFP29279 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms