Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD34P28906 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD34P28906 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CD34P28906 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD34P28906 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms