Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTR2AP28223 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HTR2AP28223 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms