Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSSP25774 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms