Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNE1P24864 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms