Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFSF4P23510 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms