Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SP100P23497 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SP100P23497 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SP100P23497 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SP100P23497 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SP100P23497 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SP100P23497 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SP100P23497 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms