Protein–RNA interactions for Protein: P23248

RPS1B, 40S ribosomal protein S1-B, yeast

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	P23248	NOP9	YJL010C	2001 nt		0.14	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	TAD1	YGL243W	1203 nt		0.13	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	SPO11	YHL022C	1197 nt		0.13	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YOL014W	YOL014W	375 nt		0.13	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	RFX1	YLR176C	2436 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	VAM3	YOR106W	852 nt		0.12	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	BIR1	YJR089W	2865 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	snR5	snR5	204 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YFR057W	YFR057W	456 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	GPG1	YGL121C	381 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	CWC23	YGL128C	852 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	QCR9	YGR183C	201 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	RPL26A	YLR344W	384 nt		0.11	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YGR228W	YGR228W	345 nt		0.1	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YHL042W	YHL042W	453 nt		0.1	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	YLR252W	YLR252W	306 nt		0.1	□□□□□ -2.39
RPS1B	P23248	LOA1	YPR139C	903 nt		0.09	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YDR344C	YDR344C	444 nt		0.08	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		0.08	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	UBC7	YMR022W	498 nt		0.08	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YOL013W-A	YOL013W-A	192 nt		0.08	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		0.08	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	PET111	YMR257C	2403 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	MLP2	YIL149C	5040 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	ZIP2	YGL249W	2115 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YGR115C	YGR115C	780 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YJR079W	YJR079W	330 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	SDS22	YKL193C	1017 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YOR248W	YOR248W	303 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	CSM4	YPL200W	471 nt		0.07	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		0.06	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	CDC33	YOL139C	642 nt		0.06	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	POP7	YBR167C	423 nt		0.06	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YPT6	YLR262C	648 nt		0.05	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	MLP1	YKR095W	5628 nt		0.05	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YDR269C	YDR269C	324 nt		0.04	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	BSC3	YLR465C	309 nt		0.04	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	YOR108C-A	YOR108C-A	210 nt		0.04	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	PKH2	YOL100W	3246 nt		0.04	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	AFR1	YDR085C	1863 nt		0.03	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	RCN2	YOR220W	798 nt		0.03	□□□□□ -2.4
RPS1B	P23248	VIK1	YPL253C	1944 nt		0.03	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	BIG1	YHR101C	1008 nt		0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	COX12	YLR038C	252 nt		0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	FYV10	YIL097W	1551 nt		0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	ESP1	YGR098C	4893 nt		0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	STE5	YDR103W	2754 nt		0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YGL230C	YGL230C	444 nt		0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YPL044C	YPL044C	549 nt		0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	snR9	snR9	187 nt		0	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YJL135W	YJL135W	318 nt		0	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	ILM1	YJR118C	612 nt		0	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		0	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	VMA21	YGR105W	234 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YCL002C	YCL002C	792 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	snR13	snR13	124 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YBR063C	YBR063C	1215 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	INP2	YMR163C	2118 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YMR254C	YMR254C	309 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YNL050C	YNL050C	813 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	YPR039W	YPR039W	336 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPS1B	P23248	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	MRPL32	YCR003W	552 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YER078W-A	YER078W-A	165 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	SCEI	Q0160	708 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	IRC16	YPR038W	360 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	SEC8	YPR055W	3198 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	MND1	YGL183C	660 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YGL239C	YGL239C	315 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	PRP5	YBR237W	2550 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	AFB1	YLR040C	675 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YOR053W	YOR053W	342 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	PRP42	YDR235W	1635 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YDL187C	YDL187C	330 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	APQ13	YJL075C	417 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YOL160W	YOL160W	342 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	RPB10	YOR210W	213 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	OLI1	Q0130	231 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPS1B	P23248	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	ECM9	YKR004C	1134 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YDR029W	YDR029W	315 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	MRPS8	YMR158W	468 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	snR190	snR190	190 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPS1B	P23248	COG8	YML071C	1824 nt		-0.11	□□□□□ -2.43

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