Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms