Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2B1P20020 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms