Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB4P16144 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms