Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODC1P11926 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODC1P11926 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ODC1P11926 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms