Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGAMP11215 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms