Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4V1P10720 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms