Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC192P0DO97 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC192P0DO97 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms