Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CGB3P0DN86 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CGB3P0DN86 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms