Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2AF1L5P0DN76 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms