Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM200BP0CF97 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms