Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR29P0C7W0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR29P0C7W0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms