Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP10P09238 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP10P09238 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP10P09238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP10P09238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP10P09238 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP10P09238 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP10P09238 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms