Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA4P06727 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOA4P06727 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOA4P06727 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA4P06727 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOA4P06727 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms