Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EGFRP00533 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EGFRP00533 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EGFRP00533 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms