Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POP4O95707 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POP4O95707 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
POP4O95707 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POP4O95707 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POP4O95707 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POP4O95707 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POP4O95707 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POP4O95707 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
POP4O95707 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms