Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNTO95613 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNTO95613 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNTO95613 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCNTO95613 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCNTO95613 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCNTO95613 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNTO95613 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNTO95613 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNTO95613 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNTO95613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCNTO95613 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms