Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNKO75909 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCNKO75909 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCNKO75909 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms