Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SKAP2O75563 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKAP2O75563 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms