Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR2O75167 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR2O75167 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms