Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBNO60934 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBNO60934 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBNO60934 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBNO60934 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBNO60934 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBNO60934 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms