Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSPAN2O60636 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms