Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CREB3O43889 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CREB3O43889 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CREB3O43889 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CREB3O43889 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREB3O43889 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms