Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAB2O43741 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms