Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HTATSF1O43719 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTATSF1O43719 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms