Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF3O43395 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF3O43395 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms