Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA3O43365 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms