Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIN2DO15399 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms