Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAF5O00463 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF5O00463 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms