Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3QKU1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3QKU1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3QKU1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3QKU1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3QKU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
J3QKU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
J3QKU1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms