Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H3BNH8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3BNH8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H3BNH8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H3BNH8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H3BNH8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H3BNH8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms