Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E9PMD0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E9PMD0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E9PMD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E9PMD0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E9PMD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E9PMD0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms