Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PATL2C9JE40 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PATL2C9JE40 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms