Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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