Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIPT2A6NK58 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms