Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF233A6NK53 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF233A6NK53 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF233A6NK53 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF233A6NK53 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF233A6NK53 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF233A6NK53 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms