Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
STRCP1A6NGW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRCP1A6NGW2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms