Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC160A6NGH7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC160A6NGH7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms