Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms