Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP17L4A6NCW7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms